O farmacêutico fica responsável pelo estabelecimento de procedimentos operacionais padrão (POPs) da área, das rotinas em caso de acidentes com antineoplásicos e também pelo descarte dos resíduos. É do farmacêutico a responsabilidade pela manutenção do banco de dados da central de quimioterapia onde devem constar todas as prescrições manipuladas, com nomes, data, medicamentos, dosagens, validade, lotes, entre outras informações que possibilitem a rastreabilidade de todos os medicamentos utilizados.
São atribuições do farmacêutico avaliar os componentes presentes na prescrição médica quanto à quantidade, qualidade, compatibilidade, estabilidade e suas interações.
No caso do tratamento sistêmico do câncer de mama, as drogas usadas na quimioterapia (QT), como já foi exposto, seguem esquemas preconizados e o farmacêutico deve estar atento aos efeitos colaterais esperados (toxicidade inerente à droga) e às reações de hipersensibilidade e/ou toxicidade individuais. Nos medicamentos via oral, também é muito importante que o farmacêutico oriente o paciente quanto ao correto modo de tomar os medicamentos, minimizando as dúvidas e checando a adesão ao tratamento. Isso é fundamental no caso de antineoplásicos usados via oral, uma vez que nem sempre são adquiridos em hospitais e farmácias, sendo fornecido por distribuidoras, tipo delivery.

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